Розовый пеликан занесён в Красную Книгу России, как вид, находящийся под угрозой исчезновения. В настоящее время он гнездится только в долине Маныча. Современная численность вида в России колеблется от 54 до 125 гнездящихся пар и достигает после размножения 230-400 особей. Основным фактором, приведшим к резкому снижению численности вида, стало сокращение площади их местообитаний и применения химических средств.