В России залёжки атлантического подвида серого тюленя располагаются в Мурманской области. Иногда подвид встречается в Архангельской области, в акваториях Земли Франца-Иосифа, Чешской губе, Карском и Белом морях, на острове Новая Земля. Балтийский подвид обитает в акватории Балтийского моря, Финском, Ботническом и Рижском заливах. Предпочитает селиться в прибрежной зоне вдоль скалистых берегов. Балтийский тюлень размножается на припайных (неподвижных) льдах, а атлантический — на пологих, каменистых берегах.

    Балтийскому подвиду серого тюленя угрожает исчезновение уже в недалеком будущем, численность этих животных критическая, и необходимы экстренные меры по их спасению. Ситуация с атлантическим подвидом не такая драматичная. В Красной книге России он отнесен к третьей охранной категории, однако вне территории России этот вид довольно обычен. С 1975 года запрещены промысел серого тюленя, спортивная и любительская охота на него. Хотя в свое время за убой серого тюленя полагалась премия. Считалось, что эти животные уничтожают рыбные запасы.