Причины количественного снижения популяции каспийских тюленей ученые видят в серьезных объемах коммерческого промысла на каспийского тюленя за прошлое столетие.
В настоящее время главная причина гибели каспийских тюленей – попадание в браконьерские сети, широко расставленные для ловли рыбы осетровых пород, а также циркулирующий в популяции вирус чумки.
Другой причиной гибели каспийских тюленей можно считать растущее загрязнение Каспийского моря. Ежегодно попадают миллиарды кубических метров разнообразных сельскохозяйственных токсических загрязнителей в Каспийское море.
Ищут ученые и другие причины быстрого вымирания каспийского тюленя. В частности, в ходе исследований был отмечен факт изменения кормовой базы, если раньше каспийские тюлени питались в основном разными видами каспийской кильки, то теперь бычковыми. Численность каспийских килек резко упала после загадочной массовой гибели в 2002 году.