Солонгой как вид состоит из нескольких подвидов, которые разделены между собой непреодолимыми географическими препятствиями. Снижение численности зверька наблюдается на всей территории ареала. В России особое опасение вызывает дальневосточная популяция забайкальского подвида. Некогда массовый, к настоящему времени он почти полностью исчез. Одной из причин стала активная деятельность человека в местах обитания солонгоя, прежде всего, распашка земель под сельскохозяйственные культуры. Это привело к уменьшению численности мелких грызунов, которые составляют значительную долю рациона солонгоя, а также способствовало успешному расселению его агрессивного конкурента — колонка (представителя семейства куньих, отличающегося прожорливостью и более крупными размерами).